Radniecības koeficients alpakām: vienkārši izskaidrots, ar kalkulatoru

Aprēķini radniecības koeficientu

Ievadi ērzeli un mātīti, kurus vēlies pārot, kā arī viņu vecākus un vecvecākus, ciktāl tos zini. Kalkulators meklē dzīvniekus, kas parādās abās pusēs, un no tiem aprēķina plānotā crias radniecības koeficientu. Ar piemēriem vari izmēģināt, kā izpaužas tipiskas radniecības pakāpes.

Kā kalkulators novērtē rezultātu

Alpakām oficiālas robežvērtības nav. Tāpēc kalkulatora pakāpes balstās uz zināmām radniecības pakāpēm un ir domātas kā orientieris, nevis kā noteikums.

• Kopīgs sencis nav atrasts: Ievadītajās paaudzēs neviens dzīvnieks neparādās abās pusēs. Tas nenozīmē, ka ērzelis un mātīte noteikti nav radinieki.
• Zems: zem 6,25%, tātad zem vērtības, ko dod brālēna un māsīcas pārošana. Kopīgie senči ir tālāk pagātnē.
• Ievērojams: no 6,25% līdz zem 12,5%. Tas atbilst vismaz brālēna un māsīcas pārošanai.
• Augsts: no 12,5%, tātad vismaz pusbrāļu un pusmāsu pārošanas līmenī. Pilnbrāļu un pilnmāsu, kā arī vecāku un pēcnācēju pārošanai vērtība ir 25%.

Ko izsaka radniecības koeficients

Katrs cria no katra gēna manto divas kopijas, vienu no tēva un vienu no mātes. Ja tēvs un māte ir radinieki, abas kopijas var cēlties no viena un tā paša kopīga senča gēna. Ģenētiķi šādas kopijas sauc par identiskām pēc izcelsmes. Radniecības koeficients F (ģenētikā saukts arī par inbrīdinga koeficientu) parāda, cik liela ir šī varbūtība jebkurā gēna lokusā. To 1922. gadā ieviesa amerikāņu ģenētiķis Sūels Raits (Sewall Wright).

Tātad cria ar F = 25% vidēji ceturtdaļā savu gēnu lokusu ir homozigots attiecībā uz kopiju, kas cēlusies no kopīga senča. Cria no diviem neradniecīgiem vecākiem ir F = 0%.

Vērtība attiecībā pret zināmajiem ciltsrakstiem

Radniecības koeficients vienmēr ir relatīvs attiecībā pret dzīvniekiem, kas ir ciltsrakstos. Dzīvnieks pašā augšā, kuram nav ievadītu vecāku, aprēķinā skaitās neradniecīgs un nav tuvradniecīgs. Tāpēc vērtība 0% nozīmē: zināmajos ciltsrakstos kopīga senča nav. Tālākā pagātnē tāds tomēr var būt.

Tipiskās vērtības

Turpmāk norādītās vērtības ir spēkā, ja paši kopīgie senči nav tuvradniecīgi. Tās vari pārbaudīt kalkulatorā ar piemēriem.

Kā rēķina pēc Raita formulas

Aprēķinam meklē visus ceļus, kas no tēva caur kopīgu senci ved pie mātes. Katrs ceļš dod savu daļu rezultātā:

F = Σ (1/2)^(n1 + n2 + 1) × (1 + F_A)

Šeit n1 ir paaudžu skaits no tēva līdz kopīgajam sencim, n2 ir paaudžu skaits no mātes līdz šim pašam sencim, un F_A ir paša senča radniecības koeficients. Summas zīme Σ nozīmē: visu ceļu ieguldījumus saskaita.

Piemērs: pusbrālis un pusmāsa

Ērzelim Cosmo un mātītei Lunai ir viens un tas pats tēvs, Apollo. No Cosmo līdz Apollo ir viena paaudze, no Lunas līdz Apollo arī. Ar n1 = 1 un n2 = 1 iegūst (1/2)^3 = 1/8, tātad 12,5%. Pilnbrāļiem un pilnmāsām nāk klāt otrs ceļš caur kopīgo māti, un abi ieguldījumi kopā dod 25%.

Ja kopīgais sencis pats ir tuvradniecīgs

Ja Apollo pats ir tuvradniecīgs, viņa paša divas kopijas jau ar zināmu varbūtību ir identiskas pēc izcelsmes. Tad kopijas, ko viņš nodod diviem pēcnācējiem, sakrīt arī tad, ja viņš tiem nodod dažādas. Reizinātājs (1 + F_A) to atspoguļo. Piemērs no Oklahomas štata universitātes informatīvās lapas: tēvu, kura paša radniecības koeficients ir 25%, pāro ar viņa meitu. 25% vietā teļam iegūst (1/2)^2 × 1,25 = 31,25%. Kalkulators to ņem vērā, ciktāl senča vecāki ir ciltsrakstos.

Ceļš nedrīkst divreiz iet caur vienu dzīvnieku

Ceļš skaitās tikai tad, ja tajā, izņemot kopīgo senci, neviens dzīvnieks nav divreiz. Piemēram, pilnbrāļiem un pilnmāsām kopīgi senči ir arī vecvecāki. Taču viņu ceļi iet caur brāļu un māsu tēvu vai māti un tāpēc jau ir saskaitīti. Lielos ciltsrakstos ar roku tas ātri kļūst nepārskatāmi. Tāpēc kalkulators izmanto radniecības matricu (tabulas metodi) un uzskaita atsevišķo senču ieguldījumus pēc ceļu metodes. Abas metodes dod vienu un to pašu rezultātu.

Kāpēc tuvradniecība ir svarīga alpaku audzēšanā

Tuvradniecība nerada jaunus iedzimtus defektus. Taču tās dēļ recesīvās pazīmes, ko dzīvnieks nemanāmi nes, biežāk sastopamas divkāršā devā un tad kļūst redzamas. Oklahomas štata universitātes informatīvā lapa to apraksta liellopu piemērā. Sekas tur aprakstītas kā labi pierādītas visām lielajām lauksaimniecības dzīvnieku sugām.

Produktivitātes kritumu tuvradniecības dēļ sauc par inbrīdinga depresiju. Pārskatā par 154 pētījumiem ar septiņām lauksaimniecības dzīvnieku sugām no 1990. līdz 2020. gadam konstatēts: ar katru tuvradniecības procentpunktu pēc ciltsrakstiem pazīme vidēji (mediāna) samazinājās par 0,13% no savas vidējās vērtības. Tas skāra visu veidu pazīmes, auglību un dzīvotspēju tāpat kā produktivitāti un ķermeņa uzbūvi. Par pašām alpakām pētījumu līdz šim ir maz. Nav pamata sagaidīt, ka tās būtu izņēmums.

Situācija Eiropā

1. gadā publicētā genomiskā pētījumā ar 179 alpakām no Vācijas, Austrijas un Šveices konstatēta līdzīga ģenētiskā daudzveidība kā alpakām no Peru. Autori no tā secina, ka audzētāji abos reģionos daudzveidību labi saglabā. Populācijai kopumā tā ir laba ziņa. Par tavu nākamo pārošanu tas pasaka maz. Vai ērzelis un mātīte ir radinieki, redzams viņu ciltsrakstos.

Un tur daži vārdi parādās atkal un atkal. Zināmus vaislas ērzeļus izmanto daudzas saimniecības, viņu pēcnācējus pārdod, un pēc dažām paaudzēm tie atkal satiekas citā saimniecībā. Kas ērzeli izvēlas tikai pēc šķiedras un eksterjera, to neredz.

Cik paaudžu vajag ciltsrakstos

Visi senči, kas nav ievadīti, aprēķinā skaitās neradniecīgi. Ja to trūkst, radniecības koeficients sanāk par zemu. Uz to jau 1992. gadā norādīja darbs par piena liellopu ciltsvērtības novērtēšanu. Pētījums ar vairāk nekā 12 000 alpakām kādā Peru audzētavā to rāda skaidri: vidējais radniecības koeficients bija 0,165%, taču vecvecāki bija zināmi tikai 25 līdz 43% dzīvnieku. Autori arī pašu ciltsrakstu dziļumu uzskata par neuzticamu.

Cik daudz dod kopīgs sencis, atkarīgs no tā, cik tālu pagātnē viņš ir. Ja viņš gan tēvam, gan mātei ir starp vecvecākiem, tie ir 3,125%. Vienu paaudzi tālāk, starp vecāku vecvecvecākiem, vairs tikai 0,78%, vēl vienu paaudzi atpakaļ aptuveni 0,2%. Atsevišķi tas ir maz. Bet, ja tas pats ērzelis parādās vairākās līnijās, ieguldījumi summējas.

Praksē tas nozīmē: ar trim paaudzēm virs crias tu droši atpazīsti tuvu radniecību. Ja zini ceturto paaudzi, ievadi arī to, kalkulatorā tam ir izvēles rūtiņa. Un jo vairāk dzīvnieku tavos ciltsrakstos ir nezināmi, jo piesardzīgāk vērtē zemu rezultātu.

Kā praksē izvairīties no tuvradniecības

Pilnībā izvairīties no radniecības audzēšanā izdodas reti. Taču tu vari parūpēties, lai to zinātu, pirms cria ir ceļā.

Pārbaudi plānoto pārošanu iepriekš

Aprēķini radniecības koeficientu, pirms ved mātīti pie ērzeļa, nevis tikai dzemdību laikā. Pilnbrāļu un pilnmāsu, pusbrāļu un pusmāsu un vecāku ar viņu pēcnācējiem pārošana ir tuvākā tuvradniecības forma. Oklahomas informatīvā lapa iesaka nepārot brāļus un māsas, kā arī vecākus ar viņu pēcnācējiem.

Izvēlies vaislas ērzeli apzināti

Palūdz svešā ērzeļa īpašniekam ciltsrakstus, vislabāk vairākās paaudzēs. Salīdzini tos ar savu mātīšu līnijām. Ērzelis, kas der tavām mātītēm, nav automātiski tas, kurš uzvarēja pēdējā izstādē.

Dokumentē līnijas rūpīgi

Katram dzīvniekam pieraksti tēvu un māti, arī iepirktiem dzīvniekiem un svešiem vaislas ērzeļiem. Saglabā izcelsmes apliecinājumus un pārnes tos, kamēr dokumenti ir pa rokai. To, kas trūkst šodien, pēc dažiem gadiem bieži vairs nevar papildināt.

Radniecības koeficients ALPAKA.PRO

Kalkulators šajā lapā pārbauda vienu pārošanu. ALPAKA.PRO audzēšanas programmatūrā katrai plānotajai pārošanai redzi radniecības koeficientu un radniecības pakāpi procentos ar norādi par saiti, kas aprēķināti no tavu dzīvnieku ciltsrakstiem. Kopīgus senčus programmatūra parāda vairākās paaudzēs, un pārošanas ieteikumi ar luksoforu parāda, kuri ērzeļi der mātītei. Ciltsrakstus veido vairākās paaudzēs, arī ar dzīvniekiem ārpus tava ganāmpulka, un eksportē tos PDF vai attēla formātā pircējiem un biedrībām.

Ja tavi ciltsraksti jau ir Excel vai citā programmā, tev tie nav jāpārraksta. Tu atsūti mums failu, un mēs ielādējam dzīvniekus, ciltsrakstus un veselības datus, parasti vienas dienas laikā un bez maksas, arī izmēģinājuma periodā. Kā tas notiek, lasi sākumlapā sadaļā Datu imports.